Potensi Madu Kelulut (Heterotrigona Itama) Sebagai Inhibitor IL6 Dengan pendekatan In Silico

Authors

  • Samsul Hadi Unversitas Lambung Mangkurat
  • Nazwa Rahmadina Universitas Lambung Mangkurat
  • Rizka Ramadani Universitas Lambung Mangkurat

DOI:

https://doi.org/10.58794/jfarm.v2i1.628

Keywords:

IL6, docking, madu kelulut

Abstract

Inflamasi merupakan kondisi peradangan yang disertai rasa sakit dan demam. Pada umumnya obat antiinflamasi bekerja dengan inhibitor enzim siklooksigenase  dan phospholipase A2 yang berperan dalam mensintesis mediator inflamasi seperti prostaglandin dan tromboksan. Berbagai penelitian dikembangkan untuk mencari agen terapi yang lebih efektif dan memiliki resiko yang lebih rendah baik gejala peradangan akut ataupun konsekuensi jangka panjang dari penyakit radang kronis. Salah satu pendekatan yang dilakuan adalah mengembangkan inhibitor IL6.  Metode yang dilakukan adalah screening senyawa aktif menggunakan  in silico. Software docking yang dipergunakan dalam penelitian ini adalah PLANTS   dan visualisasi interaksi menggunakan  discovery studio, bahan yang dipergunakan dalam penelitian ini adalah senyawa yang terkandung dalam madu kelulut (Heterotrigona itama) dan protein IL6 dengan kode 5FUC.  Hasil dari penelitian ini adalah skor docking bernilai negative dibawah - 40, sehingga reaksi yang terjadi antara ligand dan protein akan berjalan spontan yaitu Ferulic acid: -45.783; p-Coumaric acid: -51.803; trans-Cinnamic acid: -75.999; Salicylic acid: -60.056. Kesimpulan dalam penelitian ini didapatkan senyawa dengan nilai skor terendah yaitu trans-Cinnamic acid.

References

E. Ricciotti and G. A. FitzGerald, “Prostaglandins and inflammation.,” Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol., vol. 31, no. 5, pp. 986–1000, May 2011, doi: 10.1161/ATVBAHA.110.207449.

C. S. Williams, M. Mann, and R. N. DuBois, “The role of cyclooxygenases in inflammation, cancer, and development,” Oncogene, vol. 18, no. 55, pp. 7908–7916, 1999.

M. Ricke-Hoch et al., “Impaired immune response mediated by prostaglandin E2 promotes severe COVID-19 disease,” PLoS One, vol. 16, no. 8, p. e0255335, Aug. 2021, [Online]. Available: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0255335

N. Hashemi Goradel, M. Najafi, E. Salehi, B. Farhood, and K. Mortezaee, “Cyclooxygenase-2 in cancer: A review.,” J. Cell. Physiol., vol. 234, no. 5, pp. 5683–5699, May 2019, doi: 10.1002/jcp.27411.

B. Liu, L. Qu, and S. Yan, “Cyclooxygenase-2 promotes tumor growth and suppresses tumor immunity,” Cancer Cell Int., vol. 15, no. 1, p. 106, 2015, doi: 10.1186/s12935-015-0260-7.

S. Saperstein, L. Chen, D. Oakes, G. Pryhuber, and J. Finkelstein, “IL-1beta augments TNF-alpha-mediated inflammatory responses from lung epithelial cells.,” J. Interf. cytokine Res. Off. J. Int. Soc. Interf. Cytokine Res., vol. 29, no. 5, pp. 273–284, May 2009, doi: 10.1089/jir.2008.0076.

ChemAxon, “ChemAxon - Software Solutions and Services for Chemistry and Biology,” MarvinSketch, Version 16.10.31. 2016. [Online]. Available: https://chemaxon.com/

E. Krieger and G. Vriend, “YASARA View—molecular graphics for all devices—from smartphones to workstations,” Bioinformatics, vol. 30, no. 20, pp. 2981–2982, Oct. 2014, doi: 10.1093/bioinformatics/btu426.

D. S. Biovia, “Discovery Studio Visualizer,” 2019. https://discover.3ds.com/discovery-studio-visualizer-download#_ga=2.4935860.685747970.1587999055-a5d1c1c0-3176-11e9-a86f-e302515d21c8

C. Nichols et al., “Mining the PDB for Tractable Cases Where X-ray Crystallography Combined with Fragment Screens Can Be Used to Systematically Design Protein-Protein Inhibitors: Two Test Cases Illustrated by IL1β-IL1R and p38α-TAB1 Complexes.,” J. Med. Chem., vol. 63, no. 14, pp. 7559–7568, Jul. 2020, doi: 10.1021/acs.jmedchem.0c00403.

S. Kang, T. Tanaka, and T. Kishimoto, “Therapeutic uses of anti-interleukin-6 receptor antibody.,” Int. Immunol., vol. 27, no. 1, pp. 21–29, Jan. 2015, doi: 10.1093/intimm/dxu081.

Y. Li, J. Zhao, Y. Yin, K. Li, C. Zhang, and Y. Zheng, “The Role of IL-6 in Fibrotic Diseases: Molecular and Cellular Mechanisms.,” Int. J. Biol. Sci., vol. 18, no. 14, pp. 5405–5414, 2022, doi: 10.7150/ijbs.75876.

A. M. K. Rothman et al., “Effects of Interleukin-1β Inhibition on Blood Pressure, Incident Hypertension, and Residual Inflammatory Risk,” Hypertension, vol. 75, no. 2, pp. 477–482, Feb. 2020, doi: 10.1161/HYPERTENSIONAHA.119.13642.

Y.-Q. Zhou et al., “Interleukin-6: an emerging regulator of pathological pain,” J. Neuroinflammation, vol. 13, no. 1, p. 141, 2016, doi: 10.1186/s12974-016-0607-6.

T. Tanaka, M. Narazaki, and T. Kishimoto, “IL-6 in inflammation, immunity, and disease.,” Cold Spring Harb. Perspect. Biol., vol. 6, no. 10, p. a016295, Sep. 2014, doi: 10.1101/cshperspect.a016295.

Downloads

Published

2024-02-01

Issue

Section

Articles